연말정산 의료비가 누락됐다면 병원이나 약국에서 의료비 영수증을 발급받아 회사에 직접 제출하면 됩니다. 간소화 서비스에 표시되지 않는다고 해서 해당 의료비를 공제받을 수 없는 것은 아닙니다.
다만 실제로 의료비를 지출했는지 확인할 수 있는 영수증이나 진료비 납입확인서가 필요하며, 실손보험금으로 보전받은 금액은 의료비 세액공제 대상에서 제외해야 합니다.
목차
먼저 누락된 의료비를 다시 확인하세요
간소화 자료에서 의료비가 빠졌다고 생각되면 다음 항목을 먼저 확인하는 것이 좋습니다.
- 진료받은 사람의 자료가 맞는지
- 부양가족 자료제공 동의가 완료됐는지
- 진료일이 해당 귀속연도에 포함되는지
- 병원과 약국 자료가 각각 조회되는지
- 결제 취소나 환불 내역이 반영됐는지
- 실손보험금 수령액을 별도로 조회했는지
부양가족이 진료받은 의료비를 근로자의 간소화 화면에서 확인하려면 해당 가족의 자료제공 동의가 필요할 수 있습니다. 자료제공 동의가 되어 있지 않으면 실제 의료비가 발생했더라도 근로자의 간소화 화면에 나타나지 않을 수 있습니다.
다만 간소화 화면에 의료비가 표시되는 것과 실제 세액공제를 받을 수 있는지는 별개의 문제입니다. 근로자가 실제로 부담한 의료비여야 하며, 다른 가족이 같은 금액을 중복으로 공제해서는 안 됩니다.
병원이나 약국에 영수증을 요청하세요
자료가 계속 조회되지 않는다면 의료비를 지출한 병원이나 약국에 연락해 다음 서류를 요청합니다.
- 진료비 계산서·영수증
- 진료비 납입확인서
- 약제비 계산서·영수증
- 의료비 세액공제용 증빙서류
병원에 요청할 때는 다음과 같이 말하면 됩니다.
연말정산 의료비 세액공제에 사용할 진료비 납입확인서 또는 의료비 영수증을 발급해 주세요.
의료기관에 따라 서류 명칭은 다를 수 있습니다. 다만 진료받은 사람, 의료기관, 진료기간, 실제 납입금액을 확인할 수 있는 서류여야 회사의 연말정산 증빙자료로 제출할 수 있습니다.
국세청에 누락 자료 신고하기
연말정산 간소화 서비스가 개통된 뒤에도 의료비가 조회되지 않는다면 홈택스에서 조회되지 않는 의료비 신고센터가 운영되고 있는지 확인할 수 있습니다.
이 신고센터는 연중 상시 운영되는 메뉴가 아니라 연말정산 기간 중 국세청이 정한 기간에 운영될 수 있으므로, 해당 귀속연도의 공지와 접수기간을 확인해야 합니다.
신고 화면에서는 일반적으로 다음과 같은 정보를 입력하거나 확인하게 됩니다.
- 의료기관 이름
- 의료기관 사업자등록번호
- 진료받은 사람
- 진료일자 또는 진료기간
- 실제로 지출한 의료비
- 의료비 영수증 관련 정보
신고가 접수되면 국세청이 의료기관에 자료 제출을 요청할 수 있습니다. 다만 신고했다고 해서 간소화 화면에 반드시 즉시 반영되는 것은 아닙니다.
회사 제출기한이 얼마 남지 않았거나 신고센터 운영기간이 끝났다면 국세청 반영을 기다리기보다 병원이나 약국에서 받은 영수증을 회사에 직접 제출하는 편이 안전합니다.
회사에 직접 제출하는 방법
간소화 자료에 의료비가 누락됐을 때는 누락된 금액을 확인할 수 있는 서류를 회사의 연말정산 담당자에게 제출합니다.
일반적인 제출 순서는 다음과 같습니다.
- 병원이나 약국에서 영수증 발급
- 진료받은 사람과 실제 납입금액 확인
- 실손보험금 수령액 확인
- 회사 연말정산 담당자에게 증빙 제출
- 의료비 지급명세서와 소득·세액공제신고서에 누락 금액 반영
- 최종 신고서에 반영됐는지 확인
회사에서 연말정산 간소화 PDF만 제출받는 경우라도 누락 의료비 영수증은 별도 파일이나 종이 서류로 제출할 수 있습니다. 회사마다 제출 방법과 마감일이 다르므로 인사팀이나 급여 담당자에게 먼저 확인하세요.
실손보험금을 받은 의료비는 전부 공제할 수 없습니다
병원비를 신용카드나 현금으로 결제했더라도 같은 의료비에 대해 실손보험금으로 보전받은 금액은 의료비 세액공제 대상에서 제외해야 합니다.
예를 들어 병원비로 100만 원을 지출하고 해당 병원비에 대한 실손보험금으로 70만 원을 받았다면, 원칙적으로 실제로 부담한 30만 원을 기준으로 의료비 세액공제 여부를 확인해야 합니다.
연말정산 간소화 서비스에서 의료비 자료와 실손보험금 수령액은 별도의 항목으로 제공될 수 있습니다. 의료비에서 보험금이 자동으로 모두 차감됐다고 생각하지 말고, 보험금 지급내역을 확인해 공제 대상 의료비에서 직접 제외해야 합니다.
실손보험금 수령액을 제외하지 않고 의료비 전액을 신고하면 과다공제가 될 수 있으므로 보험사 지급내역과 귀속연도를 함께 확인하세요.
의료비의 공제 대상과 한도, 실손보험금·본인부담상한제 환급금 제외 기준은 의료비 세액공제 기준에서 함께 확인할 수 있습니다.
공제 대상이 아닌 비용도 확인하세요
의료비 영수증이 있다고 해서 모든 금액이 세액공제 대상이 되는 것은 아닙니다.
대표적으로 다음 비용은 의료비 공제에서 제외될 수 있습니다.
- 실손보험으로 보전받은 금액
- 국민건강보험 본인부담상한제로 환급받은 금액
- 미용·성형 목적의 수술비
- 치료 목적이 아닌 건강증진용 의약품이나 건강기능식품 구입비
- 간병인에게 직접 지급한 비용
- 외국 의료기관에 지출한 의료비
치료 목적으로 지출한 비용인지, 근로자가 실제로 부담한 금액인지 구분한 뒤 제출해야 합니다. 세부적인 의료비 공제 범위는 국세청 공식 홈페이지의 해당 귀속연도 연말정산 안내에서 확인할 수 있습니다.
연말정산이 끝난 뒤 누락을 알았다면
회사에 서류를 제출하지 못했거나 연말정산이 끝난 뒤 의료비 누락을 발견했다면 5월 종합소득세 신고나 경정청구를 이용할 수 있습니다.
5월 종합소득세 신고
근로소득만 있는 사람이라도 연말정산에서 빠진 공제항목이 있다면 다음 해 5월 종합소득세 신고 기간에 누락된 의료비를 반영해 환급을 신청할 수 있습니다.
이때 병원 영수증과 진료비 납입확인서를 보관하고, 홈택스 신고 과정에서 누락된 의료비를 직접 입력해야 합니다. 실손보험금이나 본인부담상한제 환급금처럼 보전받은 금액은 제외해야 합니다.
경정청구
5월 종합소득세 신고에서도 의료비를 반영하지 못했다면 경정청구를 검토할 수 있습니다. 연말정산에서 누락한 공제는 일반적으로 법정신고기한이 지난 후 5년 이내에 경정청구할 수 있습니다.
경정청구는 홈택스에서 신청하거나 관할 세무서에 관련 증빙을 제출하는 방법으로 진행할 수 있습니다. 구체적인 신고 방법과 적용기한은 국세청 연말정산 안내와 홈택스에서 확인하세요.
의료비 누락과 자료 오류는 다릅니다
간소화 자료에 의료비가 아예 표시되지 않는 경우와 금액이 실제 납입액과 다른 경우는 대응 방법이 다를 수 있습니다.
| 상황 | 먼저 할 일 |
|---|---|
| 의료비가 아예 조회되지 않음 | 병원이나 약국에서 영수증 발급 |
| 금액이 실제보다 적거나 다름 | 의료기관에 실제 납입금액 재확인 |
| 가족 의료비가 보이지 않음 | 부양가족 자료제공 동의 확인 |
| 실손보험금이 자동 차감되지 않음 | 보험금 수령액을 확인해 직접 제외 |
| 회사 제출기한이 임박함 | 영수증을 회사에 직접 제출 |
| 연말정산이 이미 끝남 | 5월 종합소득세 신고 또는 경정청구 검토 |
연말정산 간소화 자료에 의료비가 누락됐을 때는 병원이나 약국에서 의료비 영수증을 발급받아 회사에 직접 제출하면 됩니다. 간소화 서비스에 반영될 때까지 기다리다가 회사 제출기한을 놓치지 말고, 실손보험금이나 본인부담상한제 환급금으로 보전받은 금액은 제외한 뒤 실제 부담한 의료비만 신고해야 합니다.